Одним из самых сильных мест автомобилей BMW Е36 является их трансмиссия. Этим машина оснащаются очень надежными полностью синхронизированными пятиступенчатыми механическими и автоматическими коробками передач. При этом «механика» требует лишь регулярной замены масла (примерно через каждые двадцать тысяч километров пробега), а «автомат» вообще прослыл «неубиваемым»: зачастую срок его службы значительно превышает срок службы двигателя. При этом все автоматические коробки передач, устанавливаемые на BMW Е36, имеют микропроцессорное управление и снабжаются переключателями режимов «зима-спорт-экономия».